MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 33223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	GAGC	2	8	68	75	25 %	0 %	50 %	25 %	387781699
2	NC_017382	CATT	2	8	154	161	25 %	50 %	0 %	25 %	387781699
3	NC_017382	GAT	3	9	162	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781699
4	NC_017382	T	6	6	299	304	0 %	100 %	0 %	0 %	387781699
5	NC_017382	AAAGCA	2	12	328	339	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387781699
6	NC_017382	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781699
7	NC_017382	T	7	7	358	364	0 %	100 %	0 %	0 %	387781699
8	NC_017382	T	7	7	386	392	0 %	100 %	0 %	0 %	387781699
9	NC_017382	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781699
10	NC_017382	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781699
11	NC_017382	ACC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387781699
12	NC_017382	C	6	6	440	445	0 %	0 %	0 %	100 %	387781699
13	NC_017382	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781700
14	NC_017382	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781700
15	NC_017382	TGC	2	6	546	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781700
16	NC_017382	C	6	6	682	687	0 %	0 %	0 %	100 %	387781700
17	NC_017382	AAC	2	6	737	742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781700
18	NC_017382	CT	3	6	743	748	0 %	50 %	0 %	50 %	387781700
19	NC_017382	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781700
20	NC_017382	TCTG	2	8	850	857	0 %	50 %	25 %	25 %	387781700
21	NC_017382	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781700
22	NC_017382	TTGCAA	2	12	907	918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387781700
23	NC_017382	AAAT	2	8	952	959	75 %	25 %	0 %	0 %	387781701
24	NC_017382	CTA	2	6	981	986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781701
25	NC_017382	AAC	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781701
26	NC_017382	CTC	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387781701
27	NC_017382	CCA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387781701
28	NC_017382	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781701
29	NC_017382	CA	3	6	1266	1271	50 %	0 %	0 %	50 %	387781701
30	NC_017382	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	387781701
31	NC_017382	TC	3	6	1325	1330	0 %	50 %	0 %	50 %	387781701
32	NC_017382	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	387781701
33	NC_017382	GGC	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387781701
34	NC_017382	GCTT	2	8	1495	1502	0 %	50 %	25 %	25 %	387781701
35	NC_017382	CT	3	6	1601	1606	0 %	50 %	0 %	50 %	387781701
36	NC_017382	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	387781701
37	NC_017382	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781701
38	NC_017382	TAG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781701
39	NC_017382	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781702
40	NC_017382	A	7	7	1817	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	387781702
41	NC_017382	ATTATA	2	12	1835	1846	50 %	50 %	0 %	0 %	387781702
42	NC_017382	CCTG	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	387781702
43	NC_017382	ATG	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781702
44	NC_017382	CCAA	2	8	1874	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	387781702
45	NC_017382	TCA	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781702
46	NC_017382	TGAA	2	8	1914	1921	50 %	25 %	25 %	0 %	387781702
47	NC_017382	TTG	2	6	1938	1943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781702
48	NC_017382	CA	3	6	1953	1958	50 %	0 %	0 %	50 %	387781702
49	NC_017382	T	6	6	2016	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	387781702
50	NC_017382	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781702
51	NC_017382	CAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781702
52	NC_017382	AATG	2	8	2104	2111	50 %	25 %	25 %	0 %	387781702
53	NC_017382	AAT	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781702
54	NC_017382	TAG	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781702
55	NC_017382	G	6	6	2229	2234	0 %	0 %	100 %	0 %	387781702
56	NC_017382	ATTC	2	8	2389	2396	25 %	50 %	0 %	25 %	387781702
57	NC_017382	A	8	8	2581	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	387781703
58	NC_017382	TCTT	2	8	2597	2604	0 %	75 %	0 %	25 %	387781703
59	NC_017382	T	7	7	2677	2683	0 %	100 %	0 %	0 %	387781703
60	NC_017382	T	7	7	2719	2725	0 %	100 %	0 %	0 %	387781703
61	NC_017382	AGC	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781703
62	NC_017382	GC	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	387781703
63	NC_017382	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	387781703
64	NC_017382	AG	3	6	2987	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	387781703
65	NC_017382	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387781703
66	NC_017382	AGA	2	6	3104	3109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387781703
67	NC_017382	CAAA	2	8	3140	3147	75 %	0 %	0 %	25 %	387781703
68	NC_017382	GTG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387781703
69	NC_017382	GCC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387781703
70	NC_017382	TTG	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781703
71	NC_017382	TGC	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781704
72	NC_017382	GAAA	2	8	3287	3294	75 %	0 %	25 %	0 %	387781704
73	NC_017382	GAAA	2	8	3362	3369	75 %	0 %	25 %	0 %	387781704
74	NC_017382	AGTG	2	8	3383	3390	25 %	25 %	50 %	0 %	387781704
75	NC_017382	TG	3	6	3469	3474	0 %	50 %	50 %	0 %	387781704
76	NC_017382	GTT	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781704
77	NC_017382	CAAG	2	8	3863	3870	50 %	0 %	25 %	25 %	387781704
78	NC_017382	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	387781704
79	NC_017382	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781704
80	NC_017382	GGC	2	6	4019	4024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387781704
81	NC_017382	GGT	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017382	TAT	2	6	4173	4178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017382	A	6	6	4207	4212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017382	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017382	ATGC	2	8	4314	4321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017382	TGG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017382	GTG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017382	ACC	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017382	GGT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017382	A	7	7	4612	4618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017382	T	8	8	4632	4639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017382	AAT	2	6	4653	4658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017382	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017382	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017382	T	6	6	4864	4869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017382	A	6	6	4874	4879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017382	A	6	6	4890	4895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017382	TGT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017382	TTTTA	2	10	4948	4957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017382	C	6	6	4994	4999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017382	AAAG	2	8	5002	5009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017382	A	9	9	5015	5023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017382	A	8	8	5032	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017382	CCATG	2	10	5199	5208	20 %	20 %	20 %	40 %	387781705
105	NC_017382	GCTT	2	8	5224	5231	0 %	50 %	25 %	25 %	387781705
106	NC_017382	T	6	6	5230	5235	0 %	100 %	0 %	0 %	387781705
107	NC_017382	CATT	2	8	5295	5302	25 %	50 %	0 %	25 %	387781705
108	NC_017382	ATT	2	6	5317	5322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781705
109	NC_017382	ATA	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781705
110	NC_017382	A	6	6	5569	5574	100 %	0 %	0 %	0 %	387781705
111	NC_017382	GTT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781705
112	NC_017382	TAA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781705
113	NC_017382	TTGA	2	8	5707	5714	25 %	50 %	25 %	0 %	387781705
114	NC_017382	TTA	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781705
115	NC_017382	GTG	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387781705
116	NC_017382	GTT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781705
117	NC_017382	CGTG	2	8	5872	5879	0 %	25 %	50 %	25 %	387781705
118	NC_017382	C	6	6	5979	5984	0 %	0 %	0 %	100 %	387781705
119	NC_017382	AGT	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781705
120	NC_017382	T	6	6	6062	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	387781705
121	NC_017382	AGA	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387781705
122	NC_017382	GCG	2	6	6192	6197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387781705
123	NC_017382	TTGCT	2	10	6206	6215	0 %	60 %	20 %	20 %	387781705
124	NC_017382	CGA	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781705
125	NC_017382	CTG	2	6	6417	6422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781705
126	NC_017382	GTT	2	6	6481	6486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781705
127	NC_017382	TAT	2	6	6504	6509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781705
128	NC_017382	TTA	2	6	6521	6526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781705
129	NC_017382	CAG	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781705
130	NC_017382	TTTG	2	8	6561	6568	0 %	75 %	25 %	0 %	387781705
131	NC_017382	T	6	6	6604	6609	0 %	100 %	0 %	0 %	387781705
132	NC_017382	TTG	2	6	6646	6651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781705
133	NC_017382	GTT	2	6	6746	6751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781705
134	NC_017382	TGGT	2	8	6760	6767	0 %	50 %	50 %	0 %	387781705
135	NC_017382	CT	3	6	6794	6799	0 %	50 %	0 %	50 %	387781705
136	NC_017382	CCGTTC	2	12	6803	6814	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387781705
137	NC_017382	CA	3	6	6816	6821	50 %	0 %	0 %	50 %	387781705
138	NC_017382	CCG	2	6	6855	6860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387781705
139	NC_017382	ATCG	2	8	6943	6950	25 %	25 %	25 %	25 %	387781705
140	NC_017382	GCT	2	6	6970	6975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781705
141	NC_017382	CGTT	2	8	6978	6985	0 %	50 %	25 %	25 %	387781705
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145	NC_017382	TGT	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017382	A	15	15	7317	7331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017382	T	6	6	7334	7339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017382	G	6	6	7370	7375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017382	TTG	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017382	T	7	7	13114	13120	0 %	100 %	0 %	0 %	387781710
274	NC_017382	CAA	2	6	13162	13167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781710
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411	NC_017382	CAA	2	6	20362	20367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781716
412	NC_017382	TAAA	2	8	20518	20525	75 %	25 %	0 %	0 %	387781717
413	NC_017382	GCGA	2	8	20527	20534	25 %	0 %	50 %	25 %	387781717
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452	NC_017382	AAAT	2	8	22362	22369	75 %	25 %	0 %	0 %	387781718
453	NC_017382	A	7	7	22389	22395	100 %	0 %	0 %	0 %	387781718
454	NC_017382	A	6	6	22411	22416	100 %	0 %	0 %	0 %	387781718
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463	NC_017382	AAG	2	6	22828	22833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017382	CCATG	2	10	22999	23008	20 %	20 %	20 %	40 %	387781719
465	NC_017382	CTCTT	2	10	23029	23038	0 %	60 %	0 %	40 %	387781719
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498	NC_017382	A	14	14	25124	25137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_017382	GTT	2	6	25199	25204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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